Открыть Virtual Dub, открыть первый видео сегмент. Командой append video segment добавить второй видео сегмент и так далее... Затем сохранить. И всё. Обязательно только, чтобы в менюшках Video и Audio была галочка напротив Direct Stream Copy. Иначе файлы будут ещё и перекодироваться...